Erzurum'a bağlı Kındığı köyünde doğdu.
Babası Hacı Hüseyin Efendi, annesi Seyyide Hatice Hanım'dır.
Efe Hazretleri'nin muhterem babası, zâhirî ve bâtınî ilimlerde yed-i tûlâ (tam bilgi) sâhibi olan Hâce Hüseyin Efendi'dir.
Efe Hazretleri'nin Büyükbabası: Hâce Muhammed Efendi; Annesi: Seyyide Hadîce Hanım Büyükannesi: Fâtıma Hanım'dır.
Efe Hazretleri anne cihetiyle Seyyid'dir.
Allahu Teâlâ'nın (cc) nûrunun, kudret ve sınırlarının kapısı olan; Allah Dostları arasında değeri yüksek ve derecesi yüce bulunan Muhammed Lütfi Hazretleri'nin meşhûr lakabı: Efe veya Alvarlı Efe'dir.
Efe ta'bîri, Efendi ünvanından kısaltmadır.
Erzurum Bölgesi'nde hal ve kemal; ilim ve irfan sahibi insanlara hürmet ve muhabbet ifadesi olarak, Efe denilmektedir…
Kendilerine Hâce (Hoca) denilmesi de, ilim sahibi ve Nakşibendî Tarîkati silsilesinin altın halkalarından birisi olduğundandır.
Tahsilini babası Hacı Hüseyin Efendi'den tamamlamış, 1889'da Hasankale'nin Sivaslı Camii'ne İmam olarak tayin edilmiştir.
Aynı sene Bitlis'e giderek Hacı Pir-i Küfrevi'ye intisab etmiş ve tekrar Hasankale'ye dönmüştür.
Bir müddet sonra Erzurum'un Dinarkom köyüne gitmiş ve orada birinci cihan harbine kadar ikamet etmiştir.
Rusların Erzurum'u işgali sırasında babasını Erzurum'a bırakarak kendisi Erzurum'un Yavi nahiyesine gitmiş ve Rus istilası müddetince burada imamlık yapmıştır.

O AYNI ZAMANDA MİLLİ BİR KAHRAMAN
Ermenilerin katliama başlaması üzerine civar köylerden topladığı altmış kadar çete halindeki müfreze ile Rusların karargah deposu olan köye taarruz etmiş ve Ermenileri püskürtmüş kendisi müfrezesiyle birlikte Oyuklu köyünün yanında bulunan Ruslar'a ait bir depoyu yağma ettirmiş ve oradan Haydari Boğazı yanındaki Türk ordusuna ittifak ederek ordu ile birlikte Erzurum'a girmiştir.

HÜSEYİN EFENDİ ŞEHİD DÜŞMÜŞTÜR
Hemen babasının yanına gitmiş, babasını kana bulanmış ağır yaralı bir halde bulmuştur.
Mehmet Lütfi Efendi'nin babası Hüseyin Efendi o gün vefat etmiştir.
Daha sonra Alvarlı Mehmet Efendi Hasankale'ye bir saat mesafede olan Alvar Köyünde ikamet etmiş ve bu köyde yirmi dört sene vazife yapmıştır.
Daha sonra hastalığı sebebiyle on altı sene Erzurum'da ikamet etmiş ve 12 Mart 1956 tarihinde Baki aleme hicret etmiştir..
Alvar köyüne götürülerek babası Hüseyin Efendi'nin yanına defnedilmiştir.
Muhammed Lütfi Efendi'nin "Hulasatü'l Hakayık" ve "Mektubat-ı Hacı Muhammed Lütfi" isminde bir eseri vardır.

SOFRASINA MİSAFİRSİZ OTURMAZDI
Alvarlı Muhammed Lütfi Efendi ömrü boyunca taşı taşın üstüne koymamış bir ev sahibi olmayı dahi hatırlamamış, dünya malına sahip olmayı hiç arzu etmemiştir.
Yirmi iki yaşından doksan yaşına kadar altmış sekiz sene sofrasına misafirsiz oturmamış, kendisine ziyarete gelenlere daima iyi muamele etmeği, hiçbir kimseyi incitmemeyi ve hiç bir ferdi hor görmemeyi kendisine düstur edinmiş hülasa Ahlak-ı Muhammedi kendisinde tekamül etmiş bir insan-ı kamil idi. Efe Hazretlerinin Erzurum Destanı başlıklı eserinden birkaç mısra aktarıyor, Alvarlı Muhammed Lütfi Efendi'yi rahmet ve minnetle anıyoruz.

Erzurum kilidi mülk-i islamın,
Mevlaya emanet olsun Erzurum,
Erzurum dermendi ehl-i imanın
Mevla'ya emanet olsun Erzurum
Gayet şecaatli erler var idi
Nisası ricali hayadar idi..
Edepli, erkanlı bir diyar idi
Mevla'ya emanet olsun Erzurum
Hamdülillah metin İslamları var
Fakire zaife ihsanları var
Gülbe-i gönülde imanları var
Mevla'ya emanet olsun
Erzurum Hayrat hasenatlı erleri vardır
Hayr ü bereketli güzel diyardır
Seyretsen alemi bu aşikardır
Mevla'ya emanet olsun
ErzurumVaizleri kürsileri bezetmiş
Candan geçmiş, emrullahı gözetmiş
Allah için sohbetini uzatmış
Mevla'ya emanet olsun Erzurum
Ramazan'da bir al'i şan ederler
O şehri sıyamı zi-şan ederler
Fukara gönlünü Gülşen ederler
Mevla'ya emanet olsun
Erzurum Civanlar pirlere hürmet ederler
Duasın almaya gayret ederler
Ramazan'a güzel hürmet ederler
Mevla'ya emanet olsun Erzurum
Hafızları binbir hatim okurlar
Nur-i Kur'an enharına akarlar
Nüzul-ı merhamet-gahe bakarlar
Mevla'ya emanet olsun Erzurum
Binbir hatim nuru arşı doldurmuş
Bela musibeti yerden kaldırmış
Düşmanları kahreylemiş öldürmüş
Mevlaya emanet olsun Erzurum
Rabbim beldemize merhamet ede
Ahalisi rah-ı, Mevlaya gide
Enbiya evliya bir himmet ede
Mevlaya emanet olsun Erzurum.
Binlerce bin medfun evliyası var
Zahir batın nice asfiyası var
Feyz-ü berekat-ı Kıbriyası var
Mevlaya emanet olsun Erzurum
Rabbim hıfzeyle düşman şerrinden
Gazab göstermeye berr-ü bahrinden
Hususa ki Erzurum 'un şehrinden
Mevlaya Emanet olsun Erzurum
Kalblerinde dolsun feyz-i Rabbani
Ahalisi bulsun rahmi Rahmani
Lütfi Erzurum 'dan gördün ihsanı
Mevlaya emanet olsun Erzurum.